PCR Based Mutation Detection
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- 본문내용
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PCR-Based Mutation Detection
PCR-Based Mutation Detection
Hybridization
Electrophoresis
PCR
Hybridization
DNA 또는 RNA의 특정한 염기서열이 위치하는 부위를 밝히는 방법
nucleic acid sequence의 특정한 부분이 이에 대응하는 probe와 결합하는 특성을 이용
Probe
Radioactively labled probe
Colorimetric labled probe
Affecting factors (1)
Blocking reagents used
The time of hybridization
The volume of hybridization solution
The presence of dextran or other polymer in the hybridization solution
Affecting factors (2)
The salt concentration of the hybridization solution
The solvent concentration of the hybridization solution
The hybridization temperature
The washing condition
Hybridization
Northern blotting : RNA detection
Southern blotting : DNA detection
Western blotting : protein detection
ASO hybridization
Allele specific oligonucleotide hybridization
Southern blotting의 한 방법
Dot hybridization
: 전체 DNA를 전기영동없이 이전 후 oligonucleotide probe 사용 결합
ASO hybridization
Point mutation까지도 검출할 수 있는 간단하고 간편한 방법
제한효소나 전기영동 처리 없이 target DNA를 직접 nitrocellulose membrane에 흡착시켜 probe와 hybridization
Oilgonucleotide probe
19-21개 염기쌍으로 합성하고 방사성 동위원소로 표지
완전히 상보적인 유전자 서열에만 결합
Electrophoresis
단백질이나 핵산 등의 고분자물질은 하전을 띄므로 이를 기초로 하여 이들 분자를 전기장을 띤 매질(겔)에서 이동 분리시켜 이들의 순도나 성질의 분석 및 분리 등에 사용하는 방법
Electrophoresis
The net charge on the molecule at the pH at which the assay is conducted
The size and shape of the molecule
The electric field strengh
The pore size of the gel
Temperature
Electrophoresis gel
Agarose gel
Polyacrylamide gel
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