[생물학실험] metagenome

DMSO를 7%(V/V)만큼 가한다. 이때 DMSO는 세포 부유액을 섞으면서 중앙에 천천히 떨어뜨린다. 다 넣은 후에도 5 10초간 부드럽게 섞도록 한다. 7. 얼음에 10분 놓아둔다. 8. 미리 차게해 둔 microfuge tube에 200 l 씩 분주한다. 9. 사용할 때까지 -70 C deep freezer에 보관한다. 9. Reference- biochemisty.yonsei.ac.kr 연세대학교 의과대학 분자생물학 교실- http://blog.naver.com/mynameismh/110000674057- www.promega.com- http://www.takara.co.kr/catalogue2002/H/9030.htm- http://blog.naver.com/suhalin/100009756569

실험하고자 pure culure를 시행 했고, pure culture된 세균의 여러 가지 특성을 조사하기 위하여 본 실험들을 시행했다. 둘째, 미생물은 의약품을 포함한 생리활성 물질, 산업적으로 유용한 효소 등, 인간에게 유용한 물질의 보고이다. 하지만, 위의 실험에서와 같이, 배양 가능한 미생물은 전체 미생물의 1-2%에 불과하며, 나머지에 해당하는 난배양성(Uncultivated) 미생물 자원이 유용물질 연구의 걸림돌이 되어왔다. 90년대 말, Metagenome의 개념이 진행되고 도입되

실험(PCR of Co dehydrogenase gene)-Primer(Co dehydrogenase) : Primer는 공통적인 부분을 찾아 사용하기에 우리가 찾는 미생물이 공통적으로 이용하는 Co dehydrogenase를 Primer로 사용, dNTP, 마그네슘 이온(효소 활성을 위함), 튜브, 피펫, Template(세균이 가지고 있는 DNA)*2번 실험(16s rDNA sequence)-Primer(16s rDNA), dNTP, 마그네슘 이온(효소 활성을 위함), 튜브, 피펫, Template(metagenome) : 지난 실험에서 metagenome에서만 실험이 성공하였기에 metagenome을 Template로 활용.5.Method1)Template만들

metagenome 시료에서만 CO dehydrogenase gene의 band 가 나왔다. 즉, 우리가 채취한 토양에서 target cell인 CO 세균이 포함되어있다는 것과, 실험실에서 배양한 결과 세균은 제대로 자라지 않았다는 것을 알 수 있다. 그림 2에서 1.5kb band 의 16S rDNA sequence를 얻었다. 이제 이 sequence 가 업체에 보내지면, 기존에 저장되어있는 data 와 비교하여 우리가 원하는 균주가 맞는지, 혹은 어떤 균인지 동정할 수 있게 되는 것이다. 물론 세균을 동정할 때 Full sequencing 을 통해서도 가

생물학실험(1)#5 Report제출일자 : 2007. 10. 15♣ Title- 16SrDNA sequencing 을 위한 PCR product의 Vector Cloning♣ Introduction우리가 CO에서 자라는 세균을 동정하기 위해 emrichment와 pure culture 를 시켜 얻은 샘플과 metagenome 샘플을 얻었었다. 이 중 우리조는 metagenome 샘플의 PCR를 통해서 CO 세균의 DNA를 확인할 수 있었다. 이렇게해서 얻은 16SeDNA의 sequencing을 위해 업체에 의뢰해야 하지만, 이 상태로 바로 데이터를 전송할 경우, 정확한 결과를 얻기 힘들다. 그 이유는 metage