생물정보학 - 염기서열을 이용한 유전자 분석
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1. 목적
분자 수준의 생물학적 문제(유전자 분석)를 컴퓨터를 이용하여 해결한다.
2. 이론
1) 중합효소연쇄반응 (polymerase chain reaction, PCR)
중합효소연쇄반응은 아주 적은 양의 특정 DNA서열을 증폭시키는 기술이다. PCR은 하나의 세포에서 추출한 DNA로 클로닝이나 서열결정을 할 수 있을 정도로 충분히 민감하다. 그 결과, PCR은 의학적 진단, 유전자 분석, 유전 공학, 법의학적 분석에 사용될 수 있다. PCR에 관여하는 구성요소는 1. 복제될 DNA(표적 DNA), 2. PCR프라이머(표적 DNA의 양 끝 서열 중 하나에 상보적인 짧은 조각의 단일가닥 DNA) 2개, 3. DNA중합효소(의 고온에서도 견디는 세균으로부터 유래한 Taq중합효소가 가장 널리 쓰인다), 4. 뉴클레오사이드 삼인산 형태의 뉴클레오타이드, 5. 온도를 바꾸어주기 위한 PCR기계이다. PCR의 첫 단계는 주형 DNA를 약 로 1-2분간 가열하여 단일가닥으로 분리하는 것이다.
- 참고문헌
-
분자생물학 유전혁명의 이해 / David P. Clark / 도서출판 월드사이언스 / 2006. 9. 30 (1판) / p635-638, p662-690
왓슨 분자생물학 / Watson, Baker. Gann, Levine, Losick / 도서출판 바비오사이언스 / 2010. 2. 26 (6판) / p703-716
실험에 사용된 염기서열 출처;
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/EU223797.1
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/EU223669.1
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/32307245
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